Szlovákiában a hivatalos oltási naptár szerint csecsemőkortól kezdve mindenkit beoltanak a következő betegségek ellen: torokgyík, merevgörcs, szamárköhögés, fertőző májgyulladás B típusa, haemofilus invazív fertőzés, gyermekbénulás, pneumococcus-fertőzés, kanyaró, fültőmirigy-gyulladás, rózsahimlő. Kombinált oltóanyagokat használnak, egyszerre több betegség ellen oltanak. Az oltást rendszerint a gyermek 3 hónapos korában kezdik, s később az alap vakcinát – a hivatalos oltási naptár szerint – kétszer- háromszor meg kell ismételni. A felnőtteket is újra kellene oltani 15 évenként diftéria és tetanus ellen, de erről sokan megfeledkeznek. Továbbá, veszettség ellen is kötelező az oltás, ha valakit megsebesít egy veszett vagy ismeretlen állat.

Léteznek nem kötelező, kimondottan ajánlott vakcinák is. Ezek közé tartozik a Covid-19 és az influenzával szembeni oltás, melyek ingyenesek. Bizonyos veszélyeztetett személyek számára nagyon ajánlott az A típusú vírusos májgyulladás elleni oltás, amelyiknek az Általános Egészségbiztosító és a Dôvera a teljes árát, az Union az 50%-át téríti.

További nem kötelező, ám bizonyos élethelyzetekben és néhány krónikus betegségben szenvedők számára ajánlott oltás a varicella (bárányhimlő), a meningococcus és a kullancs-encephalitis elleni oltás, melyek nem ingyenesek.

Széles körben javasolt a méhnyakrák kórokozója, a HPV (humán papillomavírus) elleni védőoltás is, mely májustól ingyenes a 13 éves gyermekek számára. Idáig a biztosítók csak részben térítették az árát. Fiúknak is ajánlott.

Bizonyos oltásra külföldi út előtt is szükség lehet: vannak országok, ahová csak meghatározott védőoltások beadásának igazolásával engednek be. Például sárgaláz ellen kötelező az oltás minden olyan egy évnél idősebb személy számára, aki Afrikába megy, de Egyiptomba, Marokkóba, Tuniszba, Algériába, Líbiába nem muszáj. Aki Mekkába készül, be kell oltatnia magát járványos agyhártyagyulladás ellen. A kolera elleni oltást sehol nem követelik meg, de ajánlják, ha valaki hosszabb időre megy valamilyen veszélyeztetett övezetbe. Malária ellen is tanácsos védekezni, főleg miután Szlovákiában is regisztráltak négy, maláriában szenvedő beteget.